Простой совет (колхозный, но выясните проблему) -
Например Вы хотите скачать файл Документ.pdf с ID 2789 (по ссылке на файл будет ID).
Идем по FTP в /forum/internal_data/attachments/
далее в /2/ так как это цифра начала тысячи ID (2789) (если файл до тысячи будет, например 99, то в директории /0/ он лежит)
Найдите там и скачайте на ПК файл, который начинается на 2789-md5файла.data
Переименуйте его в нужное расширение (в примере .pdf) и откройте.
Если откроется, то все ок с файлом и тут проблема в БД. Если не откроется, то 100% проблема при переносе, файл поврежден или не перенесли полностью.