Заходим в табличку xf_node и удаляем ненужный раздел или такой запрос можно выполнить: DELETE FROM `название_нужной_БД`.`xf_node` WHERE `xf_node`.`node_id` = 3, заменив название_нужной_БД соответственно на название нужной БД и `node_id` = 3 заменить на ID удаляемого раздела.