/admin.php тоже 404? Так это или сервер криво настроен или копировали файлы не под пользователем, а под рутом, имхо. Хотя по идее, тогда должна 403-я.
Для проверки, /robots.txt (есть есть такой файл в корне) открывается нормально или бьет 404? И что в серверных логах (access.log + error.log)